Vitry, Véronique, Del Rio Espinola, Alberto, Grenet, Olivier and Moggs, Jonathan (2012) Identification et conséquences des polymorphismes chez différentes populations de cynomolgus (“Macaca fascicularis”) Implication pour les études de Toxicologie. Master Thesis.

Abstract

Le Macaca fascicularis ou cynomolgus est une espèce de primates non humains très utilisée dans la recherche médicale, tout particulièrement pour le développement de médicaments issus des biotechnologies. Tout comme chez l’Homme, il existe des polymorphismes liés à l’origine géographique chez les individus chez cette espèce.
Afin d’optimiser le choix des animaux utilisés pour les essais de recherche préclinique et d’augmenter la prédictibilité des effets du traitement chez l’Homme, une base de données intégrant des cynomolgus issus de plusieurs origines a été mise en place par le laboratoire Novartis. Cette base a été générée à partir d’un séquençage haut débit basé sur la capture d’exons suivie d’une reconstitution du génome par cartographie à partir de séquences de références.
L’étude réalisée ici a permis, dans un premier temps, d’identifier un certain nombre de polymorphismes spécifiques de l’origine des Macaca fascicularis à partir de l’analyse de données bibliographiques. Situés sur l’ADN mitochondrial ainsi que sur le chromosome Y, ces polymorphismes vont permettre la mise en place d’un essai d’identification de l’origine paternelle et maternelle des animaux, permettant ainsi de s’assurer de la provenance des cynomolgus utilisés par les équipes de développement.
Dans un second temps l’étude a permis de mettre en application les données contenues dans la base. En mettant son contenu en regard de données issues de la bibliographie ainsi qu’en l’utilisant afin d’étudier des cibles thérapeutiques, il a put être mis en évidence que son contenu nécessitait encore des étapes de vérification par un séquençage classique de Sanger. L’étude a également permis de montrer l’importance de l’étape de cartographie ainsi que l’utilité de cette base pour améliorer la prédictibilité des études précliniques.

Item Type:	Article
Date Deposited:	13 Oct 2015 13:14
Last Modified:	13 Oct 2015 13:14
URI:	https://oak.novartis.com/id/eprint/8217